Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smurf1Q9CUN6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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