Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms