Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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