Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms