Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab5aQ9CQD1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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