Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms