Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms