Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Use1Q9CQ56 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Use1Q9CQ56 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Use1Q9CQ56 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Use1Q9CQ56 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Use1Q9CQ56 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Use1Q9CQ56 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Use1Q9CQ56 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Use1Q9CQ56 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Use1Q9CQ56 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Use1Q9CQ56 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Use1Q9CQ56 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Use1Q9CQ56 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Use1Q9CQ56 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Use1Q9CQ56 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Use1Q9CQ56 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Use1Q9CQ56 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Use1Q9CQ56 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms