Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms