Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NenfQ9CQ45 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NenfQ9CQ45 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NenfQ9CQ45 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NenfQ9CQ45 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NenfQ9CQ45 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NenfQ9CQ45 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NenfQ9CQ45 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NenfQ9CQ45 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NenfQ9CQ45 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NenfQ9CQ45 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NenfQ9CQ45 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NenfQ9CQ45 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NenfQ9CQ45 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms