Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms