Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cep41Q99NF3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms