Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b1Q99NB9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms