Protein–RNA interactions for Protein: Q99N85

Mrps18a, 28S ribosomal protein S18a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps18aQ99N85 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms