Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms