Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a6bQ99N09 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms