Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4dQ99N05 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4dQ99N05 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms