Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mccc1Q99MR8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms