Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms