Protein–RNA interactions for Protein: Q99M01

Fars2, Phenylalanine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fars2Q99M01 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fars2Q99M01 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fars2Q99M01 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fars2Q99M01 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fars2Q99M01 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fars2Q99M01 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fars2Q99M01 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fars2Q99M01 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fars2Q99M01 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fars2Q99M01 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fars2Q99M01 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fars2Q99M01 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fars2Q99M01 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fars2Q99M01 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fars2Q99M01 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fars2Q99M01 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fars2Q99M01 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fars2Q99M01 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fars2Q99M01 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fars2Q99M01 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fars2Q99M01 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fars2Q99M01 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fars2Q99M01 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fars2Q99M01 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fars2Q99M01 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fars2Q99M01 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fars2Q99M01 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fars2Q99M01 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Fars2Q99M01 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fars2Q99M01 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fars2Q99M01 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fars2Q99M01 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fars2Q99M01 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fars2Q99M01 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fars2Q99M01 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fars2Q99M01 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms