Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms