Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Sh3bp5lQ99LH9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp5lQ99LH9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp5lQ99LH9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp5lQ99LH9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Sh3bp5lQ99LH9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Sh3bp5lQ99LH9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Sh3bp5lQ99LH9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Sh3bp5lQ99LH9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
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Sh3bp5lQ99LH9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Sh3bp5lQ99LH9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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