Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nmd3Q99L48 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms