Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Pacsin3Q99JB8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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