Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec3Q99J72 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec3Q99J72 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms