Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf112Q96DY5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms