Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Basp1Q91XV3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms