Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx11Q91WL6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms