Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms