Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHZ7

Imp4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Imp4Q8VHZ7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Imp4Q8VHZ7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms