Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE42

Ankrd49, Ankyrin repeat domain-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd49Q8VE42 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd49Q8VE42 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms