Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8VDP2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8VDP2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8VDP2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8VDP2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8VDP2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8VDP2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8VDP2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8VDP2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8VDP2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8VDP2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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