Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fyco1Q8VDC1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fyco1Q8VDC1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms