Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Ubxn4Q8VCH8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn4Q8VCH8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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