Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBZ3

Clptm1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clptm1Q8VBZ3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clptm1Q8VBZ3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms