Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim29Q8R2Q0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms