Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2G6

Ccdc80, Coiled-coil domain-containing protein 80, mousemouse

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc80Q8R2G6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc80Q8R2G6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms