Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Vmn1r200Q8R281 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Vmn1r200Q8R281 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r200Q8R281 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Vmn1r200Q8R281 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Vmn1r200Q8R281 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Vmn1r200Q8R281 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Vmn1r200Q8R281 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Vmn1r200Q8R281 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Vmn1r200Q8R281 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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