Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casc3Q8K3W3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms