Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssh3Q8K330 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms