Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Trappc12Q8K2L8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Trappc12Q8K2L8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Trappc12Q8K2L8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Trappc12Q8K2L8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Trappc12Q8K2L8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Trappc12Q8K2L8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms