Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms