Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nek9Q8K1R7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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