Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkn3Q8K045 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms