Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pnma3Q8JZW8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms