Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Rasgef1bQ8JZL7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rasgef1bQ8JZL7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Rasgef1bQ8JZL7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rasgef1bQ8JZL7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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