Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHX7

Rftn2, Raftlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn2Q8CHX7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rftn2Q8CHX7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms