Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG50

Rab43, Ras-related protein Rab-43, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab43Q8CG50 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rab43Q8CG50 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rab43Q8CG50 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rab43Q8CG50 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rab43Q8CG50 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rab43Q8CG50 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rab43Q8CG50 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rab43Q8CG50 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rab43Q8CG50 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rab43Q8CG50 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rab43Q8CG50 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Rab43Q8CG50 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab43Q8CG50 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab43Q8CG50 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab43Q8CG50 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab43Q8CG50 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab43Q8CG50 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab43Q8CG50 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab43Q8CG50 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab43Q8CG50 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab43Q8CG50 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab43Q8CG50 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab43Q8CG50 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab43Q8CG50 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab43Q8CG50 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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