Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ercc8Q8CFD5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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