Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx8Q8CFD4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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